Proteínas que se producen como consecuencia de la ingeniería genética. Una parte reguladora o promotora de uno o más genes se combina con un gen estructural. La proteína de fusión se forma luego de la transcripción y traducción del gen fusionado. Este tipo de proteína de fusión se utiliza en el estudio de la regulación del gen o de las relaciones estructura-actividad. No confundior con las proteínas de fusión viral.