Codificação refere-se ao tipo de atividade que torna explícitas informações estruturais, de Design, semânticas ou outras informações sobre uma parte específica de um documento, adicionando marcações à sua Transcrição (inline ou stand-off). Faz parte de uma atividade acadêmica de edição maior de fontes textuais, musicais ou outras. É baseado em uma transcrição do documento (o resultado do Reconhecimento de dados) e guiado por um modelo do documento (o resultado da modelagem). Existe uma codificação muito simples, como a transformação de Imagens visuais ou entidades conceituais em palavras, frases, textos. E uma mais complexa, que envolve códigos compartilhados por menos partes, como uma mensagem criptografada ou informações emitidas em determinados códigos.